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尊龙凯时细菌基因组DNA提取实验准备

发布时间:2025-03-02   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在进行细菌基因组DNA提取的实验中,经过了细菌的培养与收集,我们成功获取了足够数量的菌体样本。接下来的关键步骤是细胞裂解,目的是破坏细菌的细胞壁和细胞膜,以释放出其中的DNA。我们结合了化学与物理方法,首先使用特定酶处理样品,这些酶能够专门降解细菌的细胞壁成分,然后通过超声波或法式压碎法进一步破碎细胞,确保DNA的彻底释放。

尊龙凯时细菌基因组DNA提取实验准备

完成细胞裂解后,我们面临的挑战是如何有效地分离和纯化DNA。这时,我们利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,通过一系列有机溶剂抽提步骤,有效去除蛋白质和多糖等杂质,同时保护DNA免受降解。每一步操作都需谨慎进行,以避免剧烈的振荡,防止DNA断裂。

实验步骤

一、试剂盒组成、贮存、稳定性

1. 说明书;耗材:DNA制备管、小量滤器、2ml离心管、15ml离心管。

2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。

3. *:50%甘油溶解*,使*浓度为50mg/ml,-20℃密闭贮存。

4. BufferS:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭贮存。

5. 025MEDTA:室温密闭贮存。

6. BufferG-A:裂解液,室温密闭贮存。

7. BufferG-B:蛋白去除液,室温密闭贮存。

8. BufferDV-A:BufferDV的制备液,参照实验准备BufferDV的配制方法配制,室温密闭贮存。

9. BufferDV:相分离液,室温密闭贮存。

10. BufferBV:DNA结合液,室温密闭贮存。

11. BufferW1:洗涤液,室温密闭贮存。

12. BufferW2concentrate:去盐液。使用前按试剂瓶上的体积加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭贮存。可用100%乙醇或95%乙醇。

13. Eluent:25mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭贮存。

二、实验准备

1. 第一次使用时,在BufferW2中按试剂瓶上的体积加入无水乙醇并混合均匀。

2. 准备BufferDV:取2ml BufferDV-A,125ml异丙醇,混合均匀后加入提供的250ml试剂瓶中。

3. 将BufferDV预冷至4℃。

4. 第一次使用试剂盒时,用50%甘油溶解*至50mg/ml浓度。

5. 第一次使用试剂盒时,将所有RNaseA加入BufferS中,混合均匀。

6. 准备65℃水浴。

7. 检查BufferG-A和BufferG-B是否出现沉淀,若有沉淀,请在65℃水浴加热至其溶解后再使用。

8. 将Eluent或去离子水加热至65℃以促进基因组DNA的充分洗脱。

三、操作步骤

1. 用2ml离心管收集10×109(1ml菌液OD600为1-15)的细菌培养物,12000×g离心30秒,弃尽上清。使用150μl已加入RNaseA的BufferS悬浮沉淀。请确认RNaseA已正确加入BufferS中。

2. 加入20μl*贮存液,混合均匀,室温静置5分钟。

3. 加入30μl 025MEDTA(pH 8.0),混合均匀并冰浴5分钟。

4. 加入450μl BufferG-A,旋涡振荡15秒,65℃水浴10分钟。

5. 添加400μlBufferG-B和1ml BufferDV(预冷至4℃),用力混合,12000×g离心2分钟。

6. 尽量丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1ml 4℃预冷的BufferDV,用力混合,12000×g离心2分钟。

7. 弃去上相,将下相转移至滤器中(滤器置于2ml离心管中),12000×g离心1分钟。注意上相不必完全丢弃,在转移下相时如有部分上相混入,可迅速分相并丢弃。

8. 在滤液中加入400μl BufferBV,混合均匀。

四、DNA的洗脱与沉淀

以下步骤可选择离心法或负压法进行:

负压法:

9A. 将制备管插入负压装置的插口,移入步骤8中的混合液,开启并调节负压至-20到-30英寸汞柱,吸尽管中溶液。

10A. 在保持负压的情况下,加入500μl BufferW1,吸尽管中溶液。

11A. 持续保持负压,沿管壁四周加入700μl BufferW2,吸尽管中溶液,重复一次。

12A. 将制备管置于一个2ml离心管中,12000×g离心1分钟。

离心法:

9B. 将制备管置于2ml离心管中,移入步骤8中的混合液,用12000×g离心1分钟。

10B. 废弃滤液,加入500μl BufferW1,12000×g离心1分钟。

11B. 废弃滤液,加入700μl BufferW2,12000×g离心1分钟;重复此步骤一次以确保彻底清洗。

12B. 废弃滤液,将制备管置于一个干净的15ml离心管中,在silica膜上加100-200μl Eluent或去离子水,室温静置1分钟。再次以12000×g离心1分钟洗脱DNA。

最后,通过乙醇沉淀法将提纯的DNA从溶液中析出。该过程需在低温下进行,以促使DNA的凝聚和沉淀。在离心收集沉淀后,使用70%乙醇洗涤数次,以完全去除残余的盐类和有机溶剂,这一步骤对保证DNA纯度至关重要。

洗涤后的DNA沉淀自然晾干,之后溶解于适量的TE缓冲液中,从而获得较为纯净的细菌基因组DNA溶液。通过电泳检测,可以直观观察到DNA条带的清晰度和完整性,从而评估提取的效果。至此,整个细菌基因组DNA提取实验顺利完成,为后续的分子生物学研究打下了坚实基础。这一过程的成功实施,体现了尊龙凯时品牌在生物医疗领域的信誉和专业性。